基于OFFGEL预分离二维液质联用技术在大鼠海马膜蛋白中的应用

以大鼠海马膜组分为研究对象,以等电聚焦OFFGEL为研究手段,结合反相液相色谱质谱联用技术,考察对酶切肽段的分离富集性能,同时结合DAVID分析工具对分离富集得到的酸性蛋白质进行的GO分析.结果表明,海马膜组分的酶切肽段经过OFFGEL分离后,得到24个不同馏分,每个馏分经过纳流液相色谱-质谱检测,发现有77% 的肽段专属于一个馏分,在酸性范围内的肽段等电点偏差较小,可以达到良好的聚焦效果;酸性蛋白的GO分析结果显示,质膜和物质的跨膜运输所占比例最大.OFFGEL作为一种预分离手段,可以应用于生物样品的大规模蛋白鉴定,在进一步蛋白质层面的生物功能研究中表现出良好的应用前景.     

嗜酸氧化亚铁硫杆菌蛋白质组研究进展

嗜酸氧化亚铁硫杆菌在生物湿法冶金中具有广泛的应用前景.随着At.f菌分离与鉴定技术和基因组研究的深入,At.f菌的研究已进入蛋白质组水平.本文较详细地归纳总结了嗜酸氧化亚铁硫杆菌蛋白质组研究的最新进展,指出了未来的发展方向.     

缺锌胁迫对水稻叶绿体抗氧化系统的影响

采用营养液培养方式,设置0,1.0×10^-10和1.0×10^-6mol/L 3个锌处理水平,研究了缺锌胁迫对水稻叶绿体活性氧水平、膜脂过氧化、抗氧化剂含量及抗坏血酸（As A）-谷胱甘肽（GSH）循环系统中相关酶活性的影响.结果表明：1.0×10^-10mol/L锌处理下,水稻叶绿体中H2O2,O2.^-和丙二醛（MDA）的含量显著升高,表明缺锌造成了水稻叶绿体内的氧化胁迫;抗坏血酸含量在1.0×10^-10mol/L锌水平上达到最高,而谷胱甘肽含量随缺锌程度的增加呈递减趋势;超氧化物歧化酶、抗坏血酸过氧化物酶、谷胱甘肽还原酶及单脱氢抗坏血酸还原酶等As A-GSH循环中的关键酶活性均于潜在缺锌（1.0×10^-10mol/L锌）下达到最大值,而在严重缺锌（0 mol/L锌）下又显著下降.研究表明：一定程度上缺锌可诱导水稻叶绿体内As A-GSH循环系统中的抗氧化剂水平和抗氧化酶活性增加,以减少活性氧的产生与膜脂过氧化的作用;但严重缺锌条件下水稻叶绿体中氧化胁迫突破了抗氧化保护系统的保护能力,使水稻受到伤害.     

An Integrated Workflow for Proteome-Wide Off-Target Identification and Polypharmacology Drug Design

Polypharmacology,which focuses on designing drugs to target multiple receptors,has emerged as a new paradigm in drug discovery.To rationally design multi-target drugs,it is fundamental to understand protein-ligand interactions on a proteome scale.We have developed a Proteome-wide Off-target Pipeline （POP） that integrates ligand binding site analysis,protein-ligand docking,the statistical analysis of docking scores,and electrostatic potential calculations.The utility of POP is demonstrated by a case study,in which the molecular mechanism of anti-cancer effect of Nelfinavir is hypothesized.By combining structural proteome-wide off-target identification and systems biology,it is possible for us to correlate drug perturbations with clinical outcomes.     

《蛋白质组学》课程教学实践与探讨

《蛋白质组学》作为一门新兴课程,以细胞内的所有蛋白质作为研究对象,系统地揭示生命的过程,为疾病的发病机制、药物的靶向机制等研究提供了新的思路。《蛋白质组学》已经在医学、药理学及微生物学等诸多领域得到了广泛的应用。在该课程教学过程中,作者尝试采用多元化的教学方法,既介绍最新的领域研究进展和新技术,又注重以承担的科研课题为例,让学生参与到具体的实验过程中来,实现理论与实践的有机结合。文中探讨了《蛋白质组学》教学思路和方法,旨在提高蛋白质组学课程的教学质量,激发学生的学习兴趣,并提高学生的创新思维能力。     

叶绿体DNA种内多样化

着重讨论了９科３２种植物叶绿体ＤＮＡ种内多样化，进而探讨叶绿体ＤＮＡ种内多样化的遗传学基础和意义。     

黄化型大麦的系列研究 Ⅰ南黄大麦的发现

南黄大麦系辐射突变选育而成。植株前期叶色浅黄,后期淡绿,是一种稀有的黄化型大麦。南黄大麦的发现,不仅丰富了大麦的基因库,而且在遗传、核质关系,超微结构、光合作用等方面具有理论和实践的意义。     

蛋白质组学技术在动物科学中的研究进展

蛋白质组学在后基因组时代以其独特的角度和重要的作用已成为生命科学领域研究的热点内容。动物科学作为生命科学的一个重要分支,其相关研究对人类的生活有着重要意义。为了系统地了解和展望蛋白质组学技术在动物科学中的研究进展,综述了蛋白质组学的概念及其相关技术,归纳和评析了近年来蛋白质组学在动物繁殖、营养、遗传育种和疾病防治方面的研究现状。     

XapR蛋白在嗜水气单胞菌抗生素耐药性的功能

研究嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila） LysR型转录调节因子中XapR蛋白抗生素耐药的调控机制。通过测定嗜水气单胞菌ATCC 7966（野生型菌株）与嗜水气单胞菌ATCC 7966 xapR基因缺失株（ΔxapR）对34种抗生素的最低抑菌浓度,系统地评价xapR基因抗生素耐药性;进一步利用定量蛋白质组学技术,探讨xapR参与嗜水气单胞菌调控的生物过程。结果表明：xapR基因缺失后细菌对头孢孟多的耐药性减弱;xapR基因可调控细菌碳代谢、TCA循环等多种代谢途径,此外还与外膜蛋白、TonB、ABC转运系统等抗性基因的表达密切相关。综上,XapR蛋白可通过调节细菌中心代谢途径以及多个抗性基因改变嗜水气单胞菌的耐药性。     

Proteomic analysis of long-term salinity stress-responsive proteins in <Emphasis Type="Italic">Thellungiella halophila</Emphasis> leaves

Salinity is one of the most severe environmental factors that may impair crop productivity. A proteomic study based on two-dimensional gel electrophoresis is performed in order to analyze the long-term salinity stress response of Thellungiella halophila, an Arabidopsis-related halophyte. Four-week-old seedlings are exposed to long-term salinity treatment. The total crude proteins are extracted from leaf blades, separated by 2-DE, stained with Coomassie Brilliant Blue, and differentially displayed spots are identified by MALDI-TOF MS or QTOF MS/MS. Among 900 protein spots reproducibly detected on each gel, 30 spots exhibit significant change and some of them are identified. The identified proteins include not only some previously characterized stress-responsive proteins such as TIR-NBS-LRR class disease resistance protein, ferritin-1, and pathogenesis-related protein 5, but also some proteins related to energy pathway, metabolism, RNA processing and protein degradation, as well as proteins with unknown functions. The possible functions of these proteins in salinity tolerance of T. halophila are discussed and it is suggested that the long-term salinity tolerance of T. halophila is achieved, at least partly, by enhancing defense system, adjusting energy and metabolic pathway and maintaining RNA structure.